Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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