Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3aO08759 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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