Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms