Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bbip1J3QMK2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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