Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms