Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp408H7BX78 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp408H7BX78 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Zfp408H7BX78 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp408H7BX78 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp408H7BX78 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms