Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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