Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms