Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms