Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms