Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms