Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Phf11bB4XVQ1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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