Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
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