Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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