Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms