Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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