Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms