Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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