Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms