Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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