Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms