Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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