Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms