Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms