Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM8

Cenph, Centromere protein H, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenphQ9QYM8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenphQ9QYM8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenphQ9QYM8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms