Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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