Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms