Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scube2Q9JJS0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms