Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trhr2Q9ERT2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trhr2Q9ERT2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms