Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp2aQ9DB34 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms