Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms