Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tvp23bQ9D8T4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms