Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms