Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp5Q9D7S9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms