Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms