Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erich6bQ9D4S6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms