Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc6Q9D4E6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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