Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms