Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms