Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed6Q9CQG0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms