Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pole4Q9CQ36 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms