Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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