Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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