Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pbx4Q99NE9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx4Q99NE9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms