Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

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Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp26Q99MX1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms