Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Atp1b4Q99ME6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1b4Q99ME6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms