Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms