Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf112Q96DY5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms