Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6cQ91ZQ1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pde6cQ91ZQ1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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