Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Uhrf1Q8VDF2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Uhrf1Q8VDF2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf1Q8VDF2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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